تم انشاء معهد العمارة والفنون الاسلامية – تم تغير الاسم فيما بعد ليصبح قسم هندسة العمارة – في جامعة آل البيت في عام 1994 ليخدم اهداف الجامعة الاساسية , والتي تهدف الى تعزيز الشعور بالانتماء الى الحضارة الاسلامية وقيمها بالاضافة الى التعريف بتراثها الحضاري ومنجزاتها ، كل ذلك في اطار رؤية الجامعة الهادفة الى بذل الجهود لتطوير مجالات العلوم المختلفة عند المسلمين ، وبخاصة في محاولة لاعادة ربط العلوم باصولها الاسلامية.

    في عام 2002 بدأ قسم هندسة العمارة بطرح برنامج البكالوريوس في هندسة العمارة ، حيث استقبل القسم نحو 70 طالباً من مختلف انحاء الاردن . وكان طرح هذا البرنامج في اطار سعي الجامعة لاستحداث تخصصات جديدة تحقق آمال واحتياجات المجتمع اضافة الى توفير الفرصة للطلاب من جميع انحاء الاردن عامة ولابناء المفرق وماحولها خاصة لدراسة تخصص هندسة العمارة دون الحاجة الى تحمل مشقة السفر الى جامعات اخرى داخل مدن المملكة الاخرى اوالسفر خارج البلاد.

    يهدف القسم الى اعداد الموارد البشرية المؤهلة على المستوى المحلي والاقليمي ، الموارد البشرية ذات الجذور الراسخة المبينة على المبادىء النظرية والفلسفية في علم العمارة والمستندة الى المنظور الحضاري الاسلامي. موارد بشرية قادرة على التعامل مع المشاكل المعمارية في مجال العمارة كعلم ذي ارتباطات وتداخلات مع مختلف العلوم النظرية والتطبيقية. كما يهدف القسم الى خلق البيئة المعمارية والحضرية الى تتوائم مع المتطلبات الانسانية الاجتماعية ، النفسية والاقتصادية باستخدام الاساليب الصديقة للبيئة واحدث التقنيات في مجال توفير الطاقة واستدامتها. يطمح القسم بان يساهم بفاعلية في بناء الاسس العلمية وارساء القيم الثقافية التي تعكس القيم العربية الاسلامية الاصلية المتمثلة في الاردن وبالذات في جامعة آل البيت .

    يعمل القسم بصورة دؤوبة على بناء جسور التواصل مع المدارس المعمارية في الاردن والعالم العربي وعلى المستوى العالمي ، اضافة الى المؤسسات الهندسية في القطاعين العام والخاص، كما ان القسم يسعى الى تعين اعضاء هيئة تدريس مؤهلين لرفد القسم بخبراتهم البحثية والاكاديمية. من جهة اخرى، يعمل القسم بكامل طاقته على استكمال تجهيز مرافقه بما فيها المراسم وقاعات المحاضرات بالبنية التحتية اللازمة من طاولات رسم ومعدات تقنية وعلمية متطورة تتماشى مع التطور المستمر في المجالات المعمارية خاصة فيما يتعلق باستخدام الحاسوب في الرسم والاظهار المعماري ، كما يسعى المعهد الى فتح مكتبة قسم غنية بالكتب والمراجع المعمارية.