بموجب الإرادة الملكية السامية صدر نظام البعثات الدراسية في الجامعات والمعاهد العليا الأردنية بتخصص 20 % من المقاعد الدراسية لأبناء ضباط وضباط صف وأفراد القوات المسلحة الأردنية والأمن العام والمخابرات العامة والدفاع المدني لسنة 1980 وارتأت مديرية التربية والتعليم والثقافة العسكرية تأسيس مكتب البعثات العسكرية في الجامعة من بداية العام الدراسي 1994 / 1995 مـ, لتسهيل ومتابعة شؤون المبعوثين علـى حساب القوات المسلحة الأردنية - المكرمة الملكية السامية, ويقوم مكتب البعثات العسكرية بالواجبات التالية :-

1 - الاجتماع بالطلبة المستجدين بداية كل عام وإرشادهم لما سيقومون به خلال دراستهم الجامعية .

2 - الاحتفاظ بسجلات الطلبة وقيودهم التي تبين السيرة الأكاديمية للطلبة المستفيدين من المكرمة الملكية السامية .

3 - الإشراف على تسجيل الطلبة المبعوثين على نفقة المكرمة الملكية السامية على كل فصل دراسي .

4 - التأكد من تعبئة كافة المقاعد الدراسية المخصصة للقوات المسلحة الأردنية المكرمة الملكية السامية في الجامعة .

5 - يعتبر مكتب البعثات العسكرية صلة الوصل بين القيادة العامة للقوات المسلحة الأردنية - مديرية التربية والتعليم والثقافة العسكرية والجامعة .

6 - يقوم ركن البعثات العسكرية بتدقيق المطالبات المالية مع الدائرة المالية في الجامعة للطلبة المبعوثين .

7 - بالتنسيق مع القيادة العامة للقوات المسلحة الأردنية وبنك القاهرة عمان يقوم ركن البعثات العسكرية بمتابعة رواتب الطلبة المبعوثين على نفقة المكرمة .

8 -  متابعة أبناء شهداء القوات المسلحة الأردنية والأجهزة الأمنية ورفع تقارير فصليه بنتائجهم الدراسية إلى مديرية التربية والتعليم والثقافة العسكرية .