تحليلات DFT المُصحَّحة لتأثيرات pH والترطيب الميكروي في ديناميكا استضافة-واحتواء الجزيئات داخل كوكوربيت[7]يوريل: نحو نماذج تنبؤية لدمج الأدوية
أنظمة الاستضافة-والاستقبال لكوكوربيت[7]يوريل تمتاز بقوى ارتباط عالية، لكن التنبؤ بديناميكياتها الحرارية بطرق DFT التقليدية غير دقيق بسبب تجاهل ترطيب البوابات، وتوازنات البروتنة، وتغير التشكل.
يعرض البحث بروتوكول DFT محسّن يعتمد على الترطيب الميكروي، وتصحيح حالة الشحنة، ومتوسطات التشكل، مما يقلل الفجوة بين الحسابات النظرية وبيانات ITC التجريبية عبر مجموعة من الضيوف الكاتيونيين.
الهياكل حُسنت باستخدام ?B97X-D/def2-TZVP مع نموذج SMD، وأضيفت 2?4 جزيئات ماء لتمثيل الترطيب الحقيقي. تم دمج التشكلات عبر ترجيح بولتزمان، وجرى تحليل التآثرات اللا-تساهمية باستخدام RDG/NCI.
النتيجة: البروتوكول المصحح لـ pH والترطيب الميكروي يوفر طاقات ارتباط أدق ويكشف كيفية مساهمة القوى الكهربائية والكارهة للماء في ارتباط الضيوف داخل CB[7]، مع إمكانية تطبيقه على مكتبات أكبر مستقبلًا.