يقدم القسم برنامج الماجستير في الفيزياء. وقد تم كتابة ومناقشة العشرات من رسائل الماجستير والتي يمكن الرجوع اليها من الرابط الاتي والذي توفره المكتبة الهاشمية في الجامعة:
https://web2.aabu.edu.jo/thesis_site/th_show.jsp